綠色熒光蛋白是一類存在于腔腸動物體內的生物發光蛋白。GFP具有多種優點：易于檢測，靈敏度高;熒光性質穩定，耐受性強;易于表達，無細胞毒性;可用于活細胞檢測。
因此，GFP可作為報告基因用于檢測基因表達或調控，或作為融合標簽來檢測蛋白質分子的定位、遷移、構象變化以及分子間的相互作用，或者靶向標記某些細胞器。
GFP吸收的光譜最大峰值為395nm(紫外)，并有一個峰值為470nm的副吸收峰(藍光);發射光譜最大峰值為509nm(綠光)，并帶有峰值為540nm的側峰(Shouder)。
雖然450～490nm只是GFP的副吸收峰，但由于該激發光對細胞的傷害更小，因此通常多使用該波段光源(多為488nm)。
此外，GFP的光譜特性與熒光素異硫氰酸鹽(FITC)很相似，兩者通常共有一套濾光片。GFP熒光極其穩定，在激發光照射下，GFP抗光漂白(Photobleaching)能力比熒光素強，特別是在450～490nm藍光波長下更穩定。
類似的，GFP融合蛋白的熒光靈敏度遠比熒光素標記的熒光抗體高，抗光漂白能力強，因此更適用于定量測定與分析。
由于GFP熒光的產生不需要任何外源反應底物，因此GFP作為一種廣泛應用的活體報告蛋白，其作用是任何其它酶類報告蛋白無法比的。
但因為GFP不是酶，熒光信號沒有酶學放大效果，因此GFP靈敏度可能低于某些酶類報告蛋白，比如螢火蟲熒光素酶等。
觀察GFP熒光蛋白方法有：
采用熒光蛋白觀測燈是便捷、方便的觀察方法，因GFP在470nm有一個很高的吸收峰，采用 470nm激發光源能夠激發GFP發出明亮的綠色熒光，在觀察gfp熒光時，因為激發光為強烈的藍色光線，必須佩戴專業的觀察眼鏡才能觀察到清晰的熒光信號。
2. 紫外光源：
采用紫外光源(又叫紫外線燈、黑光燈)觀察也非常方便，但如果觀察植物，植物葉片的葉綠色在紫外線燈下也會發出熒光，對gfp發出的熒光也會產生干擾，另外，標本長時間在紫外光源照射下對GFP標本組織也會造成破壞。
3.熒光顯微鏡
熒光顯微鏡(Fluorescence microscope) ： 熒光顯微鏡是以紫外線為光源， 用以照射被檢物體，使之發出熒光，然后在顯微鏡下觀察物體的形狀及其所在位置。
熒光顯微鏡用于研究細胞內物質的吸收、運輸、化學物質的分布及定位等。 細胞中有些物質，如葉綠素等，受紫外線照射后可發熒光;
另有一些物質本身雖不能發熒光，但如果用熒光染料或熒光抗體染色后，經紫外線照射亦可發熒光，熒光顯微鏡就是對這類物質進行定性和定量研究的工具之一。
目前在常用的方法就是采用熒光顯微鏡觀察，熒光顯微鏡在實驗室非常普及，但不足是必須采集葉片或動物切片進行觀察，對培養的標本進行破壞，無法進行活體觀察。
